1、授權(quán)與批準(zhǔn)。建立銀行存款的內(nèi)部控制制度，首先就要確立授權(quán)與批準(zhǔn)的制度，即銀行存款收付業(yè)務(wù)的發(fā)生，需要經(jīng)單位主管人員或財(cái)務(wù)主管人員審批，并授權(quán)具體的人員經(jīng)辦，審批一般以簽字蓋章方式表示。該過程保證了銀行存款的收支業(yè)務(wù)要在授權(quán)下進(jìn)行。
2、職責(zé)區(qū)分、內(nèi)部牽制。該程序體現(xiàn)錢賬分管，內(nèi)部控制原則，具體包括：
(1)銀行存款收付業(yè)務(wù)授權(quán)與經(jīng)辦相分離。
(2)銀行存款收付業(yè)務(wù)經(jīng)辦與審查相分離。
(3)銀行存款收付業(yè)務(wù)經(jīng)辦與記賬相分離。
(4)銀行存款票據(jù)保管與銀行存款記賬人員相分離。
(5)銀行存款票據(jù)保管與印章保管相分離。
(6)銀行存款日記賬和總賬的登記相分離。
(7)銀行存款登賬與審核相分離。
(8)銀行存款收付款憑證保管與銀行存款日記賬登賬相分離。
3、記錄與審核。出納人員復(fù)核了銀行存款收付業(yè)務(wù)的原始憑證后，應(yīng)及時(shí)填制或取得結(jié)算憑證，辦理銀行的結(jié)算業(yè)務(wù)，并對(duì)結(jié)算憑證和原始憑證加蓋“收訖”或“付訖”戳記，表示該憑證的款項(xiàng)已實(shí)際收入或付出。會(huì)計(jì)人員根據(jù)會(huì)計(jì)主管審核無誤的銀行存款收付原始憑證編制銀行存款收款憑證、付款憑證。原始憑證、收款憑證、付款憑證須經(jīng)會(huì)計(jì)主管或授權(quán)稽核人員就其內(nèi)容合法性、合理性、真實(shí)性逐一審核后，并簽字蓋章才可據(jù)以登記入賬。
4、文件管理。為了保證已發(fā)生經(jīng)濟(jì)業(yè)務(wù)安全完整，對(duì)收、付款憑證可以采取混合連續(xù)編號(hào)，也可以采取分類連續(xù)編號(hào)；同時(shí)對(duì)票據(jù)由專人負(fù)責(zé)保管；票據(jù)和結(jié)算業(yè)務(wù)發(fā)生時(shí)，須經(jīng)財(cái)會(huì)部門主管人員或企業(yè)主管人員并要求經(jīng)辦人簽字。
5、核對(duì)。出納人員定期編制“銀行存款余額調(diào)節(jié)表”，交由會(huì)計(jì)主管人員檢查，同時(shí)定期進(jìn)行賬賬核對(duì)，以保證銀行存款安全。